历史上皇太极一共有26个孩子，其中有11个儿子，15个女儿，其中一个女儿为养女。在他死后，由他的第九子爱新觉罗·福临继承皇位。
女儿：
长女：敖汉固伦公主，母继妃乌喇那拉氏，嫁蒙古敖汉部郡王班第。
次女：固伦温庄长公主，名马喀塔，母孝端文皇后，先嫁蒙古察哈尔部林丹汗之子额哲，再嫁额哲弟阿布奈。
三女：固伦靖端长公主，母孝端文皇后，嫁蒙古科尔沁部奇塔特。
四女：固伦雍穆长公主，名雅图，母孝庄文皇后，嫁蒙古科尔沁部弼尔塔哈尔。
五女：固伦淑慧长公主，名阿图，母孝庄文皇后，先嫁正黄满洲旗人索尔哈，再嫁蒙古巴林部色布腾。
六女：固伦公主，母侧妃博尔济吉特氏，嫁满洲旗旗人夸札。
七女：固伦淑哲公主，母孝庄文皇后，嫁镶黄满洲旗旗人喇玛思。
八女：固伦永安长公主，母孝端文皇后，嫁蒙古科尔沁部巴雅斯护朗。
九女：母侧妃博尔济吉特氏，嫁博尔济吉特氏哈尚。
十女：县君，母庶妃纳喇氏，嫁满洲旗人瓜尔佳氏辉塞。
十一女：固伦端顺长公主，母懿靖大贵妃，嫁博尔济吉特氏噶尔玛索诺木。
十二女：乡君品级，母氏阙，嫁博尔济吉特氏班第。
十三女：母庶妃纳喇氏，嫁满洲旗人瓜尔佳氏哈拉。
十四女：和硕恪纯长公主，母庶妃察哈尔奇垒氏，嫁吴三桂之子吴应熊。
养女：（1615-—1637），生父克勤郡王岳托，生母嫡福晋哈达那拉氏，封和硕公主，额驸翰卓礼克图巴敦台吉。
儿子：
皇长子：爱新觉罗·豪格，生母继妃乌拉那拉氏。
皇二子：爱新觉罗·洛格（1611—1621），生母同皇长子，幼殇。
皇三子：爱新觉罗·洛博会（1611—1617），生母元妃钮祜禄氏，幼殇。
皇四子：爱新觉罗·叶布舒（1627—1690），生母庶妃颜扎氏，初封镇国将军。康熙8年，晋封辅国公。康熙二十九年（1690年）九月二十二日，叶布舒病死，享年64岁。
皇五子：爱新觉罗·硕塞（1629—1654），又名硕色，号霓庵，清朝宗室，满洲镶红旗人，生母侧妃叶赫那拉氏，承泽裕亲王。
皇六子：爱新觉罗·高塞（1637—1670），生母庶妃纳喇氏，镇国悫厚公，康熙九年07月22日子刻卒，年34，谥悫厚。着有恭寿堂集。满族诗人。久居沈阳，淡泊出世，好书画，精通乐理，善弹琴，有诗集《恭寿堂诗》一卷。
皇七子：爱新觉罗·常舒（1637—1699），生母庶妃伊尔根觉罗氏，初封镇国将军。康熙八年晋辅国公，十四年削爵，三十七年授辅国公，康熙三十八年逝世，年63岁。
皇八子：未命名（1637—1638），生母敏惠恭和元妃科尔沁博尔济吉特氏，幼殇。
皇九子：爱新觉罗·福临（1638—1661），生母孝庄文皇后科尔沁博尔济吉特氏，清世祖章皇帝，年号顺治，在位十八年。
皇十子：爱新觉罗·韬塞（1639—1695），生母庶妃克伊克勒氏，初封三等镇国将军，康熙八年晋辅国公。康熙三十四年（公元1695年）二月初九卒。
皇十一子：爱新觉罗·博穆博果尔（1642—1656），生母懿靖大贵妃阿霸垓博尔济吉特氏，顺治十二年（1655年）封襄亲王，顺治十三年（1656年）去世，谥号襄昭，无嗣。