明朝有十六个皇帝，却只有十三个皇帝葬入了明十三陵中，明十三陵中没有明太祖朱元璋、建文帝朱允炆和明景帝朱祁钰。由于明十三陵是永乐年间才开始修建的，所以作为明朝开国皇帝，朱元璋并没有葬在明十三陵里。
明十三陵里分别葬着明朝的十三位皇帝，其中以明成祖朱棣的长陵最先建成，而在朱棣之前的朱元璋和朱允炆，他们一个被葬在了明孝陵之中，另外一个则在靖难之役中生死未卜，下落不明，连陵墓都没有。
除了朱元璋和朱允炆没有被葬在明十三陵之外，明景帝朱祁钰也没有入葬明十三陵。不过他的原因比较特殊。他本来就不是大明的皇帝，是因为哥哥明英宗在打仗的时候不幸被敌军俘虏，朱祁钰这才捡漏坐上皇位。结果就在他登基不到一年的功夫，哥哥就被放回来了。后来明英宗朱祁镇又从弟弟朱祁钰手中夺回了皇位，朱祁钰也被贬为郕王，死后以亲王的规格下葬。