据悉，电视剧《如懿传》原定是99集，后经过删减，改为87集，这其中有不少精彩的情节都被删掉了，而原因则有2点，一个是“限古令”的问题，99集已经占据卫视一年古装播出总量的90%（一年只能播出110集古装剧），还有就是，剧中的一些情节不适合在网上播出。
《如懿传》删改的12集剧情并不是采用“拦腰斩”的方式，而是从第一集开始过滤，将小说中不合适出现的情节进行删改。
1.删除的场景
剧中，海兰被贵妃诬陷偷碳，虽然在如懿的帮助下，顺利的脱险，但还是可以看到，她身上有不少的伤口。这其中，用刑的一些场景，就做出了一些删减。另外，莲心在嫁给王钦之后被虐待，这些场景也都被删减。
2.删改的场景
在原著中，玫贵人的孩子刚刚生下来的时候，并非是个死胎，而是一个双性人，皇上在见了孩子之后，以不详之由派人将把孩子掐死后火化。剧版为了避免这种场景出现，直接改成孩子出生的时候就是个死胎。
原著中，阿箬临死之前，遭受的刑罚并不是鞭刑，而是残酷的猫刑，而且有一个场景，就是如懿抓着阿箬的手，说她指甲好看后，就命人将她的指甲拔了下来。阿箬被打入冷宫之后，可以明显的看到，她的指甲上满是鲜血，这一点也做了删改.