1、创立的时间不同：
中国同盟会于1905年8月20日在日本东京成立，是近代中国第一个全国性的资产阶级革命政党。它的内涵核心是“政党”，其性质是“资产阶级的”，这是它区别于旧式革命组织和同期其它革命团体的重要标志。
兴中会是孙中山于1894年11月24日在美国檀香山创建的中国近代第一个民主革命团体。
2、纲领不同：
同盟会的政治纲领是“驱除鞑虏，恢复中华，创立民国，平均地权”。兴中会的宗旨是“驱除鞑虏，恢复中华，创立合众政府”。
3、创立的目的不同：
同盟会的目的是为了集中革命力量。兴中会的目的是决心以暴力推翻清王朝，建立资产阶级共和国。