华佗由于受到曹操猜忌，在狱中被拷问致死，年龄约63岁。关于华佗的死因，历史上流传有两种说法，一种是曹操请华佗专门为他诊治，华佗向他请假回家，用的是妻子生病的理由，曹操屡次下召要他归来，他自持有能力而不上路，于是曹操派人查看他妻子是否真的生病，若是真的，就赐他四千升小豆，并且延长他的假期期限;若他蒙骗曹操，就逮捕他，结果华佗的妻子并未生病，于是曹操治他欺君以及不从之罪，在狱中将其拷打致死。
第二种说法来源于《三国演义》，说的是曹操特意请名医华佗来为他治疗多年不愈的头痛，华佗说要根治他的病需要劈开头颅，使用麻沸散，手术工程很大，由于曹操生性多疑，怀疑他是想趁机杀害他，便将华佗以刺杀的罪名关押了起来，严刑拷打致死。
华佗是我国历史上的名医，活动于东汉末年，是有名的医学家。他少年时曾经在外游学，苦心钻研医术，医疗知识十分全面，尤其精通外科，擅长做手术，对养生、方药、针灸，以及内、外、妇、儿科都深有研究，华佗创造的麻沸散是世界上最早使用的麻醉剂。