然而几千年来人们一直都没有发现巴别塔的遗迹，有人认为它不过是个神话。后来考古学家在古巴比伦遗址上发现了一个由石块、泥砖砌成的拱形建筑废墟，中间有口正方形的大井。开始考古学家以为这是空中花园的遗址，直到后来在附近出土了一块记载了通天塔的方位和式样的石碑，才知道这就是通天塔的塔基。通天塔建于公元前17世纪，高近90米，分成7层，底层边上也近90米，顶层是供奉马尔杜克神的神庙。用深蓝色釉砖砌成的塔身外有条螺旋形的阶梯盘旋而上，直通金色的神庙。公元前1234年，通天塔被攻占巴比伦的亚述人摧毁。后来新巴比伦的尼布甲尼撒二世曾重建该塔，但他去世后，巴比伦又渐渐衰落。公元前484年，通天塔再次毁于战火。虽然人们如今已基本复原了它的外观，然而整体的设计和结构仍是一个谜。