一种说法是在宁远战役中，努尔哈赤不幸中炮，受伤很重，回去之后不治而亡。猜测的根据是，有人亲眼见到清军一个将领模样的人被大炮击中，其他将士马上用红布将他包裹运走，并且痛哭不已。于是他们怀疑那人就是努尔哈赤。但是据清朝自己的记载，努尔哈赤并未在宁远一役中受伤，后来在会见蒙古一个部落首领的时候，他还亲迎5千米，礼节性地说幸亏自己没有生病才能见到对方。但是清朝的正史记载总会让人怀疑有避讳之嫌，那这种说法就值得商榷了。可也有书上说，努尔哈赤是死于一种叫作“肉毒瘤”的病。在当时的医疗条件下，该病很难医治，尤其对于老年人，更是有性命之忧的。大概由于宁远兵败，促发了他的旧疾，所以导致后来的不治而亡。这也是一种有待考证的推论。总之，还未来得及实现自己的宏愿，努尔哈赤就这样寂寞地走了。