大多数脊椎动物的第三眼见于颅顶部的皮肤下，例如蛙、蜥蜴的第三眼虽然被鳞片遮盖着，但也能在皮下找到。科学家们经过大量研究发现，冷血动物的第三眼被当作温度计了，可以测量周围的温度。在两栖动物中，第三眼可根据光的强弱来调节皮肤颜色。而人的第三眼已经变成一个极为独特的、专门的腺体。人体中除了松果腺体以外，再也没有其他腺体具有星形细胞。
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