小肠是条弯弯曲曲的管道，约有两米长。在小肠中，食物会被进一步分解，养分也在此处吸收。小肠和胃在幽门括约肌处相连接，小肠末端则终结于大肠的第一部分，也就是盲肠处。小肠由四层组织构成：浆膜层、肌肉层、黏膜下层及黏膜层。其最外一层称之为浆膜层，是一层薄而透明并有保护作用的膜。浆膜层紧接着一层厚而富肌肉的第二层叫肌肉层，这层包括有一层厚的环纹肌层及一层薄的纵纹肌层。环纹肌层可将胃送来的食糜加以混合，并可与纵纹肌层共同以波状运动的蠕动来将食糜推过小肠。这些肌肉层在十二指肠中最厚，而在回肠末端1米处，肌肉层则变得非常薄。紧贴于肌肉层者称为黏膜下层，其分布有血管、淋巴管以及小肠的神经。